办公室

承担图书馆日常行政、后勤，电子阅览室、视听阅览室等管理，承担图片扫描、读者证办理、接待来访等服务工作。

技术部

承担图书馆计算机自动化系统建设、管理与维护，系统开发，图书馆工作人员计算机及相关业务培训，制作读者证等。

情报室暨检索教研室

承担医学文献信息检索教学，文献信息检索，课题查新，医学信息报道，专题数据库建设，原文服务等。

采编部

承担图书馆文献采集，图书分类编目及新书报道等。

读者工作部

承担书刊流通、阅览、期刊、典藏、读者辅导等。